Со-руководство докторантом в другой научно-образовательной организации осуществляется работниками СПбГУ на основании договорных отношений между организацией, заинтересованной в привлечении со-руководителя (выступает в роли Заказчика), и СПбГУ (выступает в роли Исполнителя). Перед заключением договора между юридическими лицами (Заказчиком и Исполнителем) должны быть согласованы его условия: объем и форма занятости, компенсация транспортных и иных операционных расходов, общая стоимость услуг.
Со стороны Исполнителя (СПбГУ) решение о заключении договора на оказание услуг принимает начальник Главного управления по организации работы с персоналом, исходя из уровня квалификации и объема служебных заданий работника СПбГУ, привлечение которого предполагается для выполнения функции со-руководителя, а также целесообразности развития партнерских отношений с Заказчиком.